雲林縣新虎尾溪全長近50公里，上游從林內鄉重興村行經多個鄉鎮至台西蚊港出海，但因為沿途有許多畜牧場、工廠或生活廢水排放造成部分河段嚴重污染，雲縣府從2025年展開3年改善計畫，將興建污水下水道、沼氣中心等，現在將針對新虎尾溪上游擬定放流水加嚴管制草案，希望降低重金屬污染風險，守護河川水質及農業灌溉安全。