蘭嶼居民要往返本島幾乎都以搭船為主，全票票價1200元，政府過去對蘭嶼居民的船票補助全票450元、半票225元，但由於過去票價補助款直接從船票扣除，再由船公司向鄉公所請領的方式，造成無法控管補助款支出，今（2026）年3月鄉公所改以先由鄉民全額購票、事後再申請補助，但被居民批評非常不便民。